이 웹 사이트 뉴스 4月5Day, 국제 권위있는 저널《자연.커뮤니케이션》 (Nature Communications）Wang Jianxin 교수의 Central South University에서 컴퓨팅 스쿨 팀과 미국의 Clemson University의 Luo Feng이 온라인으로 출판했습니다교수,Sunshan UniversityZhongshan 안과 센터Xiao Chuanle어소시에이트 안전 카지노 사이트원협력의 최신 안전 카지노 사이트 결과“긴 판독 값을 기반으로 한 Daploid de Novo 어셈블리 (de novo 긴 시끄러운 읽기를 사용한 이배체 게놈 어셈블리）".이 논문3 세대 시퀀싱 데이터를 기반으로 한 새로운 이배체 조립 방법이 제안되고 해당 소프트웨어가 개발되었습니다Pecat.Central South University의 컴퓨터 과학 및 기술 대학Nie Fan,ni peng논문의 공통첫 번째 저자, Central South University의 컴퓨터 과학 학교의 Wang Jianxin 교수는종이공동 응답 저자, Central South University는 첫 번째 서명 단위입니다. 이 안전 카지노 사이트는 National Key R & D Plan, National Natural Science Foundation 및 Xiangjiang Laboratory Leadership Project와 같은 여러 프로젝트에 의해 지원됩니다.
3 세대 시퀀싱 기술 (옥스포드 나노 포어 시퀀싱 및Pacbio 단일 분자 실시간 시퀀싱)의 빠른 개발은 더 길고 정확한 독서를 생성하여 게놈 어셈블리 안전 카지노 사이트에 새로운 기회와 도전을 가져 왔습니다. 이배체 어셈블리의 경우, 3 세대 판독 값은 여전히 높은 시퀀싱 오류를 포함하고 있으며, 조립 알고리즘은 시퀀싱 오류를 일배 체형 차이 정보와 구별하기가 어렵고, 따라서 많은 수의 일배 체형 전환 오류를 포함하고 유전자 정보의 많은 부분을 잃는 일배 체형 믹스 조립 결과를 생성합니다.
이 제한에 대한 응답으로 Wang Jianxin 교수의 팀과 다른 사람들은 최근에 그것을 게시했습니다. Nature Communications의 안전 카지노 사이트 논문은 3 세대 장기 읽기 시퀀싱 오류 및 일배 체형 차이의 차이를 깊이 분석함으로써, 일배일 차이를 유지하는 장기 읽기 오류 수정 알고리즘의 장기 읽기 오류 수정 알고리즘 정보를 시퀀스 오류로서 반복적으로 피하기 위해 일배 체형 차이를 피하기 위해 제안된다. 보정 판독 값은 99.4%에 도달 할 수 있습니다. 이를 바탕으로, 로컬 일배 체형 클러스터링에 기초한 이배체 어셈블리 알고리즘은 첫 번째 조립 라운드에서 일배 체형 혼합의 조립 결과를 실현하도록 설계되었습니다. 두 번째 조립 라운드에서, 판독 값은 혼합 어셈블리 결과와 비교되며, 판독 값에 의해 수행되는 단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP) 정보가 식별되고, 일배 체형이 일관성이없는 중첩 관계는 국부 클러스터링을 통해 식별된다. 일배 체형 어셈블리 결과는 필터링되고 일관성이없는 중첩 관계가 다시 조립됩니다. 다중 테스트 데이터에서 제안 된 방법 Pecat은보다 연속적인 일배 체 조립 결과를 얻었습니다. 그중, 나노 포어 R9의 황소 데이터에서, Pecat은 거의 일배 체형 해상도로 조립 결과를 얻었습니다. 인간 HG002 샘플의 나노 포어 R10 데이터에서, PECAT는 59.4/58.0MB의 일배 체형 연속성 지수 (위상 블록 NG50)로 조립 결과를 달성했습니다.
Pecat 어셈블리 알고리즘 프레임 워크 다이어그램
첫 번째 인스턴스 : Yu Tao Second 인스턴스 : Deng Haodi 세 번째 인스턴스 : Li Yin
