보고서 제목 : 3 세대 카지노 추천싱을위한 주요 컴퓨팅 기술의 개발 및 적용

보고서 시간 :2020 년 9 월 18 일 금요일 오전 11시至12 : 30

보고서 위치 : 313, 컴퓨터 건물, 학교 본부

스피커 : Xiao Chuanle 박사 (Sunshan Ophthalmology Center, Sun Yat-Sen University)

보고서 요약 :

3 세대 카지노 추천싱 기술이 오래 읽었습니다 (대략20kbp), 없음동물 및 식물의 게놈에서 PCR 증폭 선호도 및 기본 변형 감도 및 기타 특성de novo조립 및 후성 유전 적 탐지 연구에는 명백한 이점이 있습니다. 2 세대 카지노 추천싱 기술의 강력한 보충제 또는 대체물로서 최근 몇 년 동안 연구에서 인기있는 주제가되었습니다. 연구 결과는 종종CNS 및 기타 최고의 국제 저널. 현재, 3 세대 카지노 추천싱 데이터의 높은 카지노 추천싱 오류율 (12-15%)은 3 세대 데이터 분석에 직면 한 큰 도전입니다. 높은 오류율로 인한 거대한 컴퓨팅 리소스 소비는 3 세대 카지노 추천싱의 광범위한 적용을 방해하는 주요 병목 현상입니다.먼저, 3 세대 카지노 추천싱 게놈 어셈블리에서, 우리는 전통적인 카지노 추천스 정렬 모델 대신 글로벌 종자 투표 점수 모델을 제안하고 빠른 조립 시스템을 개발합니다Mecat. 인간 데이터 세트에서 Mecat의 조립 속도는 유사한 소프트웨어 (Canu 및 Falcon)의 17-56 배입니다. 연구 결과는 2017 년 Nature Methods 저널에 발표되었습니다. 현재 Mecat은 20 개가 넘는 중국 특정 식물 게놈을 조립했습니다.. 둘째,나노 포어 카지노 추천스 보정 측면에서, 나노 포어 오류의 국소 고르지 분포 문제에 대한 응답으로, 우리는 정확도 우선 카지노 추천스 보정 모델을 제안하는데, 이는 서열 보정 속도와 정확도를 크게 향상시키고 나노 포어 빠른 조립 시스템을 개발하는데, 이는 유사한 소프트웨어 (Canu) (Canu)의 20 배인 나노 포어 빠른 조립 시스템을 크게 향상시킨다. 게다가,후성 유전 학적 변형 검출 측면에서 타겟팅Pacbio큰 게놈DNA-6MA 자원 소비 문제,우리는 게놈 지역 부서에 대한 병렬 탐지 방법을 제안합니다. 체계적으로 인간을 처음으로 드러 냈습니다DNA-6MA MAP의 분포 규칙, 유전자 발현 조절 모드, 메틸 라제 (N6AMT 및 ALKBH1) 및 암과의 관계,이 연구 결과는2018분자 세포잡지. 또한,forNanopore의 명백한 수정 감지 정확도가 낮습니다복잡한 배경 신호 문제, 우리는 식별을 설정했습니다Nanopore Velopent Modification (5MC 및 6MA) Deep Recurrent Neural Network (RNN) 모델, 해당 소프트웨어 DeepMod,전체 게놈에서 단일 염기 수준의 고정밀 감지를 구현5MC 및 6MA, 5MC 및 6MA평균 감지 정확도는 최대99%和90%, 결과는2019 년 Nature Communications Magazine에 게시.

화자 소개:

Xiao Chuanle, Ph.D. 생물 정보학, 광동성 탁월한 청소년 기금의 수상자, Sun Yat-Sen University의 Zhongshan 안과 센터의 부교수, 안과의 국가 주요 실험실과 무관하게pi. 장기 헌신카지노 추천싱 데이터 분석 방법에 대한 개발 및 애플리케이션 연구, 최근 몇 년 동안 기본 연구의 계산 병목 현상 문제와 3 세대 카지노 추천싱 유전체학 및 후성 유전학의 계산 병목 문제를 해결하기 위해 일련의 주요 알고리즘과 지원 소프트웨어가 확립되었습니다. 주요 연구 방향은 다음과 같습니다. (1) 3 세대 카지노 추천싱 데이터 게놈해당 방법 개발 : 3 세대 카지노 추천싱 카지노 추천싱 카지노 추천싱 카지노 추천싱 카지노 추천싱 카지노 추천스 비교의 시간이 소요되는 문제를 고려하여, 긴 카지노 추천스 종자 투표 점수 모델이 제안되었고 빠른 조립 시스템이 개발되었습니다Mecat계산 속도를 선명하게 향상시킵니다 (자연 방법, 2017); 을 위한나노 포어 카지노 추천싱 오류 분포 및 로컬 불균일, 정확도 우선 카지노 추천스 보정 모델이 제안되었으며, 이는 나노 포어 카지노 추천스 보정의 속도와 정확도를 크게 향상 시켰습니다 (Nature Communications, 2020);（2）3 세대 카지노 추천싱 후성 유전 학적 방법의 개발 및 적용 : 3 세대 카지노 추천싱 용Pacbio의 높은 계산 소비 및 배경 소음 문제,제안Pacbio Methylation 병렬 컴퓨팅 모델, 첫 번째 시스템은 인간을 드러냅니다DNA-6MA 메틸화 맵（Molecular Cell, 2018); 첫 번째 식별이 확립되었습니다Nanopore 전기 신호 수정 딥 러닝 모델. 각각 5mc 및 6ma의 정확도를 각각 99% 및 90%까지 식별합니다 (Nature Communications, 2019);현재 첫 번째 또는 해당 저자로자연 방법、분자 세포, 자연 커뮤니케이션 및 기타 저널을 게시하는 고급 공상 과학 논문20 개가 넘는 기사, 연속적으로 개발되었습니다Necat, DeepMod, Mecat，mecat2和Fanse2 및 10 이상생물 정보학 분석 도구,유전학의 프론티어특별 특별 이슈 게스트 편집자,게놈 생물학, 자연 통신, 생물 정보학와 같은 전문 저널의 검토 자.