보고서 제목:게놈 어셈블리의 모델 및 알고리즘
보고서 시간:12Month17 일 오전 11시
보고서 위치: 에볼루션 카지노 본부 컴퓨터 건물313
스피커:Yu Lindr.(호주호주 국립 대에볼루션 카지노)
초록 :
3 세대 시퀀싱에 의해 생성 된 긴 오류가 발생하기 쉬운 판독 값을 조립하는 최근의 획기적인 것은 오버 랩 층-컨센서스 접근법을 기반으로했으며 대안적인 de bruijn 그래프 접근법의 강점을 활용하지 않았다. 이 토크에서는 De Bruijn 그래프 모델을 일반화하여 긴 오류가 발생하기 쉬운 읽기를 조립하고 기존 최신 알고리즘보다 더 정확한 게놈 재구성을 초래하는 새로운 알고리즘을 설명하는 방법을 보여줍니다. 또한, 새로운 그래프 모델은 또한 2 세대 시퀀싱을위한 어셈블리 개선, 게놈 어셈블리의 분석, 게놈 재 배열 및 인간 게놈의 세그먼트 복제를 연결하는데도 적용될 수있다.
전기 :
Yu Lin은 호주 국립 대에볼루션 카지노 컴퓨터 과학 연구소의 강사이자 그룹 리더입니다. 그 전에는 샌디에고 캘리포니아 대에볼루션 카지노 컴퓨터 과학 공학과의 Pavel Pevzner 교수가 주최 한 박사후 학자였습니다. 그는 스위스의 École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)에서 Bernard Moret 교수로 컴퓨터 과학 박사 학위를 받았습니다. 그의 연구는 계산 생물학에 중점을두고 있으며, 게놈 어셈블리 알고리즘, 게놈 재 배열의 분석 및 계통 발생 학적 재구성에 대한 연구를 해왔다.
