스피커: Huazhong 토토 카지노 of Science and Technology의 Huang Shengyou 교수
질문: 단백질 복합 구조 예측 : 분자 도킹에서ai통합 모델링
Time: 11 월 26 일 화요일 오전 10시
위치: 컴퓨터 빌딩313회의실
보고서 요약 :
단백질은 생명 활동의 집행자입니다.“구조는 기능을 결정합니다”, 따라서 단백질 상호 작용과 그 복잡한 구조를 결정하는 것은 생명 활동과 약물 발달을 이해하는 데 중요합니다. 명확한 물리적 원리와 매우 낮은 계산 비용으로 인해 분자 도킹은 단백질 복합 구조의 예측에서 항상 가장 중요한 빠른 계산 방법이었습니다. 그러나 분자 유연성 및 에너지 스코어링 기능의 한계로 인해 정확도는 병목 현상에 도달했습니다. 최근에는 인공 지능 모델과 같은 인공 지능 모델이 있습니다alphafold2단백질 단량체 구조의 예측에서 큰 성공을 거두고 있지만 불충분 한 샘플로 인해 단백질 복합 구조의 예측 정확도는 여전히 개선되어야합니다. 따라서, 기존 단백질 복합 구조의 예측에서 병목 현상을 뚫기 위해 새로운 방법이 시급히 필요하다. 최근에, 냉동 전자 현미경은 생물학적 거대 분자의 구조를 결정하기위한 가장 중요한 실험 방법으로 발전했다. 실험 데이터에 포함 된 정보는 단백질 복합 구조 예측의 요구를 충족시킵니다. 이 보고서에서는 먼저 분자 도킹을 기반으로 단백질 복합 구조 예측 방법을 소개 한 다음 인공 지능을 기반으로 한 Cryo-Electron Microscopy 실험 밀도 맵의 복잡한 구조 정보 채굴에 대한 토토 카지노에 대한보고에 중점을 둘 것입니다.
스피커 프로필 :
Huang Shengyou, Huazhong 토토 카지노 of Science and Technology의 교수 및 박사 과정 감독관, 전국 최고의 인재이자 전국 100 개의 뛰어난 박사 학위 논문을 수상했습니다. 단백질 상호 작용 계산 및 복잡한 구조 예측에 대한 장기 연구 및 함께 출판 된 논문120Yu 장, 최근5해당 저자의 연도자연 생명 공학、자연 기계 인텔리전스、Nature Communications및 기타 저널은 논문을 출판40Yu Chapter, 개발hdock국제 단백질 복합 구조 예측에서 동등한 단백질 분자 도킹 알고리즘카프리대회에서 1 위를 차지했습니다. 국제 자연 과학 재단, 국제 협력 프로젝트 등의 주요 프로젝트에 대한 주재. 현재 중국 생물 정보 학회를 담당하고 있습니다(筹) "생체 분자 구조 예측 및 시뮬레이션 전문위원회”사무 총장.
프로젝트 그룹 웹 사이트 :http://토토 카지노lab.phys.hust.edu.cn/。
스피커: Fudan 토토 카지노의 Zhu Shanfeng 연구원
질문：Goretriever : 단백질 기능 주석에 대한 문헌 중심의 깊은 정보 검색에 의한 단백질-설명 기반 GO 후보
Time：11月26Day (화요일) 아침10点
위치: 컴퓨터 빌딩313회의실
보고서 요약 :
대다수의 단백질은 여전히 실험적으로 검증 된 기능 주석이 부족하여 고성능 자동화 된 단백질 기능 예측/주석 (AFP) 방법을 개발하는 것의 중요성을 강조합니다. 기존 접근법은 단백질 서열, 네트워크 및 구조 데이터에 초점을 맞추고 있지만 단백질과 관련된 텍스트 정보는 간과되었습니다. 그러나 Swissprot 단백질의 약 82%가 이미 전문가가 주석을 달고있는 문헌 정보를 보유하고 있습니다. 문헌 정보를 효율적이고 효과적으로 사용하기 위해, 우리는 AFP에 대한 2 단계 깊은 정보 검색 기반 방법 인 Goretriever를 제시합니다. 표적 단백질이 주어지면, 첫 번째 단계에서, 후보 유전자 온톨로지 (GO) 용어는 유사한 설명을 갖는 주석이 달린 단백질을 사용하여 검색된다. 두 번째 단계에서, GO 용어는 GO 정의와 표적 단백질의 텍스트 정보 (문헌 및 단백질 설명) 사이의 시맨틱 매칭에 기초하여 재고됩니다. 벤치 마크 데이터 세트에 대한 광범위한 실험은 AFP 성능을 향상시키는 데 Goretriever의 놀라운 효과를 보여줍니다. Goretriever는 Gocurator의 핵심 구성 요소이며, 최신 단백질 기능 주석에 대한 최신 비판적 평가 (CAFA5 : 1,600 개 이상의 팀이 참여)에서 첫 번째 자리를 달성했습니다.
화자 프로필:
Zhu Shanfeng은 Brain-Like Intelligence Science and Technology Institute의 연구원이자 Fudan 토토 카지노의 박사 과정 관리자입니다.UnipRot국제 과학 자문위원회 위원, PLOS 계산 생물학옥스포드 대학교 출판부 편집위원회Bioinformatics Advanceds차장 편집장. 그는 5 개의 National Natural 토토 카지노 Foundation 프로젝트와 국내 및 외국 기업의 여러 R & D 프로젝트를 연속적으로 주재했습니다. 주요 연구 방향은 인공 지능 및 생물 의학 빅 데이터 마이닝, 특히 생물 의학 텍스트 마이닝, 단백질 기능 예측, 메타 게놈, 스마트 의료 등입니다. 관련 논문 관련 논문은 생물 정보학, 인공 지능, 데이터 채굴 등과 같은 관련 플래그십 국제 컨퍼런스 및 저널에서 첫 번째 또는 해당 저자로 출판됩니다.Neurips, KDD, ISMB, IJCAI, ACL, Nature Communications、게놈 생물학, 생물 정보학, 핵산 토토 카지노등.2014年-2022 참석BioASQ대규모 생물 의학 텍스트의 자동 라벨링을위한 국제 경쟁에서 1 위를 8 번 졸업했습니다.2017、2020和2023 별도로 참여CAFA3、CAFA4和CAFA5대규모 단백질 기능의 자동 라벨링을위한 국제 경쟁에서 1 위를 차지하십시오.2019年-2021참석CAMI II대규모 메타 게놈 데이터 분석에 대한 국제 경쟁은 인접한 바이닝 알고리즘에서 전체적으로 1 위를 차지합니다.
